trois adultes scrutant des microscopes

Diagnostic de la coqueluche

Tests utilisés dans le diagnostic de la coqueluche (coqueluche).

Parfois, il est acceptable de diagnostiquer la coqueluche en utilisant la définition clinique de l'OMS qui est de trois semaines de toux paroxystique. C'est une très mauvaise façon de diagnostiquer la coqueluche-coqueluche car d'autres infections peuvent provoquer une toux paroxystique, et la coqueluche ne provoque pas toujours ces symptômes précis, mais peut provoquer une toux ordinaire ou être asymptomatique.

Il existe 3 tests différents. La culture, la détection des anticorps et la PCR sont tous utilisés dans le diagnostic de la coqueluche.

La PCR est bonne au cours des 3 premières semaines. Les tests d'anticorps sont bons après 2 semaines. La culture est bonne au cours des 3 premières semaines, mais uniquement avec une technique minutieuse.

Le test effectué peut dépendre de votre lieu de résidence.

Dans de nombreux pays développés, un test PCR sur un écouvillonnage de la gorge ou du nez est désormais standard (en Australie et aux États-Unis par exemple, et maintenant disponible dans les soins primaires au Royaume-Uni). Dans de nombreux autres pays, les tests d'anticorps sur un échantillon de sang sont normaux chez l'adulte et des tests d'anticorps par voie orale peuvent être effectués chez l'enfant. Dans de nombreux pays, le test effectué dépendra du laboratoire utilisé. 

Plus de détails ci-dessous.

Test d'anticorps dans le diagnostic de la coqueluche 

Il est courant mais remplacé par la PCR.

Un échantillon de sang prélevé après au moins deux semaines de maladie est utilisé. En mesurant IgG anti-coqueluche il est possible de dire s’il est probable que le patient a eu une infection par la coqueluche avec 90% de précision, à condition qu’il n’y ait pas eu de vaccination contre la coqueluche au cours des mois 12 précédents.

Cet anticorps est généralement mesuré en unités internationales (UI) et un niveau supérieur à 70 UI peut être considéré comme une preuve très forte d'infection récente.. Différents pays peuvent utiliser des seuils différents de 70 UI. L'IgA est parfois mesurée à la place, ou parfois les deux. L'IgA n'augmente qu'après une infection naturelle. Les IgG augmentent après une infection naturelle ou une immunisation.

Le test sera faussement négatif dans 10% des infections à coqueluche. Il sera également négatif dans les infections à Bordetella parapertussis et Bordetella holmesii (qui provoquent des symptômes similaires). C'est parce qu'ils ne produisent pas de toxine coquelucheuse, donc test négatif.

Le liquide buccal obtenu à l'aide d'une éponge spéciale peut être testé de la même manière pour les anticorps de la toxine coquelucheuse. Ce n'est pas aussi précis que les tests sanguins. Il y a plus de faux négatifs. Les analyses de liquide buccal sont généralement réservées aux enfants en raison de la difficulté à obtenir du sang d'eux.

Voici une référence à un document européen pertinent sur le diagnostic sérologique à échantillon unique Il s'ouvre dans un nouvel onglet

Les tests d'anticorps peuvent être effectués tard dans la maladie et toujours positifs, ce qui constitue un avantage considérable. 

Dans le  Royaume Uni un échantillon de sang provenant de cas suspects doit être envoyé au laboratoire local du NHS pour demander des «anticorps anticoquelucheux». Les résultats sont obtenus en 1 à 2 semaines. Il peut être difficile de persuader les médecins de faire le test. Au Royaume-Uni, il existe des directives claires qui incluent le test de tout patient présentant une toux paroxystique de plus de 2 semaines. Il y a d'autres circonstances décrites et les mesures à prendre. 

Directives britanniques pour les médecins ici

Il peut parfois être nécessaire d’attirer l’attention de votre médecin sur ces recommandations, car très peu d’entre elles les connaissent (personne ne peut se souvenir de toutes!). 

Aux États-Unis, il est moins probable qu'un médecin se réfère aux directives du CDC car les pratiques de santé en vigueur dans les États peuvent être prédominantes, et elles sont parfois un peu dépassées. Il y a un Page web du CDC vous pourriez trouver utile.

PCR (réaction en chaîne de la polymérase)

C'est une manière plus efficace de détecter l'organisme. Il est préférable de le faire au cours des trois premières semaines des symptômes. Généralement, le plus tôt sera le mieux. Il détecte son modèle d'ADN unique. Cela implique d'obtenir des sécrétions de l'arrière du nez ou de la gorge par écouvillon ou par aspiration et des tests dans un laboratoire spécialisé. Un résultat peut être obtenu en 24 à 48 heures.

Une PCR négative n'exclut pas la coqueluche, surtout si elle est prise aux stades ultérieurs. Il doit être positif dès le premier jour de la maladie et fiable pendant 3 semaines et peut rester positif pendant 4 semaines ou plus.

Le test PCR dépend de la présence de l’organisme, vivant ou mort. Comme il détecte des quantités infimes de matériel génétique, il est plus probable qu'il soit positif que la culture, et pour une période de temps plus longue.

La PCR présente l'avantage de pouvoir réussir un prélèvement dans la gorge, contrairement à la culture qui doit être prélevée dans une zone d'épithélium cilié où vit la bactérie, située à l'arrière du nez. Un écouvillon de gorge pour la PCR doit être envoyé au laboratoire à sec, pas dans un milieu de transport, bien que cela n’empêche généralement pas le test.

Une chose qui peut se produire avec les tests de PCR qui peut être déroutant, c'est qu'il détecte les infections qui ne sont pas associées à la maladie de la coqueluche. Certaines personnes contractent l'infection et ne présentent aucun symptôme important ou symptôme bénin, mais elles seront positives pour la PCR.

La PCR peut être trop sensible

Cela peut être un problème pour les statistiques. Par exemple, si un parent emmène un enfant atteint de coqueluche chez un médecin et qu'un échantillon est prélevé pour la PCR, le parent et le médecin peuvent prendre des dispositions pour que d'autres enfants en contact soient également testés, même s'ils ne présentent aucun symptôme. Certains peuvent montrer une PCR positive mais ne développent pas de toux coquelucheuse.

Une PCR positive de ces cas apparaîtra dans les statistiques sur la coqueluche et rendra l'incidence plus élevée. Avant la disponibilité de la PCR, seuls la coqueluche clinique, les tests sanguins et la culture étaient comptés à des fins statistiques. Ces trois sont une bonne mesure de la coqueluche clinique. La PCR, en revanche, mesure l'infection à coqueluche, qui peut être très différente, car de nombreuses infections ne se transforment pas en coqueluche. 

Si les comparaisons doivent avoir une quelconque validité, la coqueluche clinique doit être enregistrée et notifiée séparément pour les PCR positifs.

Cela peut expliquer une partie de la résurgence décrite en Australie. Ce pays est fortement tributaire de la PCR.

Un écouvillon per-nasal pour la détection de Bordetella pertussis
Un écouvillon per-nasal pour la culture bactérienne de B. pertussis

Culture

Le moyen le plus ancien et le plus difficile est d'essayer de cultiver l'organisme causal (Bordetella pertussis) à partir de l'arrière du nez. Cela implique de passer un tampon sur un fil à travers une narine à l'arrière de la gorge et de l'envoyer à un laboratoire médical. Cela peut prendre 5 à 7 jours. Si Bordetella pertussis ou parapertussis se développe, c'est la preuve qu'il s'agit d'une coqueluche. La parapertussis provoque également la coqueluche. C'est beaucoup moins courant, peut-être 1 cas sur 100. Elle peut être moins grave car elle ne produit pas de toxine coquelucheuse. La culture par prélèvement nasal n'identifie qu'environ un tiers des cas, même entre les meilleures mains.

Malheureusement, les organismes sont délicats, tués facilement par de nombreux antibiotiques et ont souvent été éliminés de l'organisme par des défenses naturelles au moment où le diagnostic est suspecté. Il est plus facile à trouver au cours des 2 premières semaines, mais très peu probable après 3 semaines. Le patient en souffre souvent depuis 3 semaines avant de soupçonner une coqueluche, so il est inhabituel d'avoir une culture positive de la coqueluche. En d'autres termes, si un écouvillon est négatif, vous pouvez toujours avoir une coqueluche.

Dans la pratique, le diagnostic doit souvent être posé uniquement sur les symptômes et l'évolution de la maladie, à moins que des tests sanguins ou d'anticorps par voie orale ou une PCR ne puissent être effectués.  

Chapitre sur la bactériologie en ligne de Todar sur la coqueluche

commentaire

Cette page a été révisée et mise à jour par Dr Douglas Jenkinson 22 mai 2020